A fitofisionomia está relacionada com a distribuição e interação das espécies vegetais de uma população, formando padrões de espécies abundantes, estrutura morfológica das espécies, estágios de desenvolvimento, entre outros fatores que corroboram na definição de uma fitofisionomia.
Duas grandes fitofisionomias florestais compõe as áreas de influência de manejo e operação da Sguario, Floresta Ombrófila Mista e a Savana.
A Floresta Ombrófila Mista, conhecida como Floresta de Araucária, a qual ocupa a porção mais ao leste das áreas rurais da Sguario, tendo como característica deste ecotipo a presença de espécies de coníferas. Araucaria angustifolia – conífera – assim como o Podocarpus sp, têm presença marcante neste ecotipo, ocorrendo também a espécie casca-de-anta, gênero Drymis.
A Savana, denominada regionalmente como Cerrado, considerada como vegetação xeromorfa, é a formação presente onde preferencialmente há o clima estacional com solos aluminizados. Na formação Cera ocorrem as espécies como o cinzeiro (Vochysia tucanorum), o pau-terra (Qualea spp.) e o angico (Anadenanthera falcata).
A região central, onde se concentra a grande maioria das fazendas, está sob uma zona de transição de duas comunidades, denominado ecótono dos ecossistemas Savana e Ombrófila Mista. A comunidade do ecótono contém organismos de cada uma das comunidades que se entrecortam, além dos organismos característicos, dificultando o desmembramento do estudo entre as diferentes comunidades fitossociológicas.
Desta forma as análises foram integradas entre as duas fitoregiões de contato (Floresta Ombrófila Mista com Savana), e duas fitofisionomias distintas (Floresta Ombrófila Mista e Savana).
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